Der Melibokusschule ist eine kooperative Gesamtschule, die einen Hauptschul-, Realschul- und Gymnasialzweig anbietet.

Als Einstieg wird die Förderstufe und parallel hierzu der gymnasiale Zweig angeboten. Es gelten dabei die Rahmenrichtlinien für den jeweiligen Schulzweig. Auch die Abschlüsse, die an einer kooperativen Gesamtschule erteilt werden, entsprechen den Abschlüssen der Hauptschule, der Realschule und dem des Gymnasiums.

Die Melibokusschule bietet Unterricht bis zur 10. Klasse an, so dass Schülerinnen und Schüler zur Vorbereitung auf das Abitur an ein Oberstufengymnasium, im Regelfall an das Schuldorf Bergstrasse wechseln (Schulverbund).

Ziel der kooperativen Gesamtschule ist es, Schülerinnen und Schülern trotz des weitgehenden Unterrichtes in den eigenen Schulzweigen Schnittstellen zu den anderen Schulformen zu bieten. So kann an der Melibokusschule beispielsweise nach der Förderstufe auch noch in den gymnasialen Zweig (Klasse 6) gewechselt werden, um dann in insgesamt 13 Jahren ("G9") zum Abitur zu kommen.